Protokoll som används i QSAR

QSAR står för Quantitative Structure Activity Relationship. Används för att visa hur en kemisk struktur kvantitativt kan korreleras till en specifik process, är QSAR ofta används för att utforma mediciner och läkemedel. Denna metod används för att styra kemisk syntes, eftersom det finns tusentals olika möjliga strukturer för en molekyl och forskarna kan annars slösa bort en massa tid att testa varenda struktur. Statistiken spelar en viktig del i metodiken för QSAR. Multipel linjär regression

Multipel linjär regressionsanalys används när det finns flera begagnade studier som alla är relaterade till en specifik kemisk struktur. En ekvation är utvecklad att, till exempel, kan visa en relation mellan en minskning av tumörstorlek och närvaron av en hydrofob grupp på den fjärde positionen av en fenylring. Denna analys minskar många olika föreningar så att korrelation kan tolkas med hjälp av endast ett fåtal parametrar som är det viktigaste.
Pattern Recognition

Mönsterigenkänning används för att definiera parametrar detta resultat när specifika kemiska strukturer är grupperade tillsammans. Det finns flera olika typer av mönsterigenkänning analys, som inkluderar huvudkomponentanalys, dator automatiserad struktur utvärdering och automatiserad dataanalys genom tekniker mönsterigenkänning. Mönsterigenkänning statistiken använder originaldata och korrelera de olika strukturerna med de biologiska resultat som bygger på olika dimensioner, med den mest betydande är i den beräknade första komponenten.
Comparative Molecular Field Analysis

Denna version av QSAR tar PLS analys paras med korsvalidering att skapa prognoser för den biologiska aktiviteten. I denna typ av metod, kommer vetenskapsmannen tilldela särskilda regler för anpassning av molekylstruktur. Var och en av molekylerna passar i ett rutnät och sedan olika interaktioner beräknas utifrån interaktioner från en probatomen till de olika näten. Det finns många olika ekvationer som kan resultera. Till skillnad från andra typer av regression, ger detta ekvationer där det finns mycket fler parametrar än möjliga föreningar Addera Apex -. 3D

Apex-3D använder ett system som automatiskt väljer den bästa anpassningen och bekräftelse för de strukturer som bygger på den nödvändiga biologiska respons från tidigare experiment. Det är möjligt att avslöja effekten av olika bindande orientering, antagonistaktivitet kontra agonistaktivitet och effekten av olika receptorer. Detta skapar 2D-och 3D topografiska matriser och kan generera information om par av molekyler snarare än enstaka molekyler.
Genetisk funktionsanpassning

Genetisk funktion approximation används när det finns få prover och många olika variabler som undersöks, och när de datamängder inte har linjära relationer. Detta använder bäst rankade modeller och värsta-klassade modeller beräknas från rådata. Det bygger bättre och bättre modeller genom att byta ut de värsta rankade modellerna. De många olika multipla passar tillhandahålls sedan till den vetenskapsman, som sedan väljer den slutliga modellen. Likheterna mellan modellerna studeras för att ge information om de strukturella och biologiska korrelationer.