Medan sensoriska och motoriska nerver medierar medveten perception och viljestyrd rörelse, fungerar stora delar av nervsystemet helt utan medvetenhet. Denna automatiska reglering är livsviktig.
- Autonomt nervsystem (ANS): Sympatisk och parasympatisk kontroll av hjärtfrekvens, matsmältning, andning, pupilldilatation, svettning — ofrivillig.
- Reflexbågar: Ryggmärgs- och hjärnstamsbanor (t.ex. knäreflex, dragreflex) kringgår hjärnan för hastighet.
- Centrala mönstergeneratorer: Ryggmärgsnätverk för rytmiska rörelser (gående, simning) som körs automatiskt en gång initierade.
- Basala ganglier och lillhjärnan: Koordinerar rörelse, hållning, balans och motorisk inlärning undermedvetet.
- Enteriskt nervsystem: Den "andra hjärnan" som styr tarmfunktionen oberoende.
Således integrerar nervsystemet sömlöst medveten vilja med omfattande automatisk reglering.