Vätskan som finns i en sköldkörtelcystor är vanligtvis en klar eller halmfärgad vätska som kan vara tunn och vattnig, eller tjockare och mer trögflytande. Det kan ibland ha en brunaktig eller rödaktig nyans på grund av närvaron av blod eller hemosiderin (en nedbrytningsprodukt av hemoglobin). Vätskan kan också innehålla protein, kolesterol och andra cellulära komponenter. I vissa fall kan cystavätskan vara grumlig eller grumlig på grund av närvaron av inflammatoriska celler eller skräp.
