Protokoll som används i QSAR

QSAR står för kvantitativa struktur -aktivitetssamband . Används för att visa hur en kemisk struktur kan kvantitativt korreleras till en specifik process , är QSAR ofta används för att designa läkemedel och droger . Denna metod används för att styra kemisk syntes , eftersom det finns många tusentals olika möjliga strukturer för en molekyl och forskare annars slösa bort en massa tid att testa varje enskild struktur . Statistik spelar en viktig roll i metoden av QSAR . Multipel linjär regression

Multipel linjär regressionsanalys används när det finns flera studier som används allt som är relaterade till en specifik kemisk struktur . En ekvation är utvecklad att , till exempel, kan visa ett samband mellan att minska tumörstorleken och närvaron av en hydrofob grupp på den fjärde positionen av en fenylring . Denna analys minskar många olika föreningar , så sambandet kan tolkas med hjälp av endast ett fåtal parametrar som är viktigast .
Pattern Recognition

Mönsterigenkänning används för att definiera parametrar detta resultat när specifika kemiska strukturer är grupperade tillsammans . Det finns flera olika typer av analys mönsterigenkänning , som omfattar huvudkomponentanalys, dator automatiserade struktur utvärdering och automatisk dataanalys av mönsterteknikerkännande. Statistik mönsterigenkännings använder originaldata och kommer att korrelera olika strukturer med de biologiska resultat baserat på olika dimensioner , med det främsta av dessa är i första beräknade komponenten . Addera Comparative Molecular Field Analysis

Denna version av QSAR tar PLS analys paras med korsvalidering för att skapa prognoser för den biologiska aktiviteten . I denna typ av metod , kommer vetenskapsmannen tilldela särskilda regler för anpassning av molekylstruktur . Var och en av de molekyler passar in i ett rutnät och sedan olika interaktioner beräknas utifrån interaktioner från en sond atom till de olika näten . Det finns många olika ekvationer som kan resultera . Till skillnad från andra typer av regression , ger detta ekvationer där det finns betydligt fler parametrar än möjliga föreningar Addera Apex - . 3D

Apex - 3D använder ett system som automatiskt väljer den bästa inriktningen och konformation för de strukturer som bygger på den nödvändiga biologiska respons från tidigare experiment . Det är möjligt att avslöja effekten av olika bindningsorientering , antagonistaktivitet kontra agonistaktivitet och effekten av olika receptorer. Detta genererar 2D-och 3D topografiska matriser och kan generera information om par av molekyler snarare än enstaka molekyler .
Genetisk Function tillnärmning

tillnärmning Genetisk funktion används när det finns få prover och många olika variabler som undersöks , och när datamängderna inte har linjära samband . Detta använder bäst - rankade modeller och värsta - rankade modellerna beräknade från rådata . Det bygger bättre och bättre modeller kvalitet genom att ersätta de värst rankade modellerna . De många olika multipla passar sedan ges till forskare , som sedan väljer ut den slutliga modellen . Likheterna mellan modellerna studeras för att ge information om de strukturella och biologiska samband. Addera