Antalet molekyler i en signalsubstans kan variera beroende på den specifika signalsubstansen, men vanligtvis finns det miljarder till biljoner molekyler av en signalsubstans inom en given synaps, som är förbindelserna mellan neuroner där neurotransmittorer frigörs. Synaptiska vesiklar, de små fack i neuroner som innehåller neurotransmittorer, kan lagra tusentals till tiotusentals neurotransmittormolekyler. När en neuron aktiveras och frigör signalsubstansmolekyler, diffunderar dessa molekyler över det synaptiska gapet och binder till receptorer på den postsynaptiska neuronen, vilket utlöser en kaskad av händelser som kan leda till generering av en aktionspotential i den postsynaptiska neuronen.
