Pilonidalcystor har en hög frekvens av återfall efter kirurgiskt avlägsnande, med rapporterade återfallsfrekvenser som varierar kraftigt i den medicinska litteraturen men varierar i allmänhet från 10 % till 30 %. Vissa faktorer som ofullständig borttagning av hela kanalen eller sinus, djup eller komplex natur av cystan, dålig sårläkning, infektion, fetma eller överdrivet hår i det drabbade området kan öka risken för återfall.
