Bakterier klassificeras grovt efter cellväggsfärgningsegenskaper:
- Grampositiva: Tjock peptidoglykanslager; behåller kristallviolettfärg.
- Gramnegativa: Tunt peptidoglykanslager med yttre membran; visas rosa efter motfärgning.
- Syrafasta: Mykolinsyra-vägg; motstår avfärgning med syra-alkohol (t.ex. Mycobacterium).
- Mykoplasma: Saknar cellvägg; minsta fritt levande bakterier.