Bakteriella interaktioner med människor: Patogena, kommensala, mutualistiska och miljömässiga roller

Bakterier engagerar sig i olika relationer med människor:

1. Patogena: Orsakar sjukdom via toxiner, invasion, immunundvikande. Exempel: S. pneumoniae (pneumoni), M. tuberculosis, V. cholerae, Salmonella, C. difficile.
2. Kommensala: Koloniserar utan skada; nytta av värdens nisch. Hud (Staph epidermidis), oral (viridans streptokocker), tarm (Bacteroides). Kan bli opportunistiska om barriär bryts.
3. Mutualistiska: Båda gynnas. Tarmmikrobiota: fermenterar fiber → SCFA (butyrat för kolonocyter), syntetiserar vitamin K₂, B₁₂, biotin; tränar immunsystem; motverkar patogenkolonisation; reglerar metabolism.
4. Miljömässiga/Ekologiska: Nedbryter organiskt material, kvävefixering (rhizobier), bioremediering, syrefotosyntes (cyanobakterier — urprung till kloroplaster).

Det humana mikrobiomet (10¹⁴ mikrober, ~3 000 arter) är ett virtuellt organ som påverkar immunitet, metabolism, neurobeteende och läkemedelssvar. Dysbios kopplas till IBD, fetma, diabetes, autism, depression, allergi.