Den huvudsakliga matsmältningsfunktionen som förekommer i magen är proteinmatsmältningen. Magen är ett muskelorgan som utsöndrar magsaft, som innehåller saltsyra och enzymet pepsin. Saltsyra skapar en sur miljö i magen, som dödar bakterier och denaturerar proteiner, vilket gör dem mer mottagliga för matsmältning av pepsin. Pepsin är ett proteas som bryter ner proteiner till mindre peptider, vilket initierar processen för proteinnedbrytning.
