Virusklassificering: Genom, struktur och transmissionstyper

Virus klassificeras efter genomtyp (DNA/RNA, stränghet, sense), kapsidsymmetri, hölje närvaro och replikationsstrategi. Baltimore-klassificeringen (7 grupper) är guldstandarden för genom-baserad taxonomi.

Baltimore-klassificering (Genom-centrerad)

Grupp	Genom	Exempel	Replikationsanmärkningar
I	dsDNA	Herpesvirus, Adenovirus, Poxvirus	Replikeras i kärnan (mest)
II	ssDNA	Parvovirus, Circovirus	Konverteras till dsDNA-intermediär
III	dsRNA	Rotavirus, Reovirus	Replikeras i cytoplasma; RNA-beroende RNA-polymeras
IV	(+)ssRNA	Poliovirus, HCV, Coronavirus (SARS-CoV-2)	Genom = mRNA; direkt översättning
V	(-)ssRNA	Influensa, Mässling, Rabies, Ebola	Kräver viralt RdRp för att göra (+)RNA
VI	ssRNA-RT (Retrovirus)	HIV, HTLV-1	Revers transkriptas → DNA → integrering
VII	dsDNA-RT	Hepatitis B	RNA-intermediär → revers transkription

Strukturell klassificering

Inhöljda: Lipiddubbellager från värdcellmembran (HIV, Influensa, HSV, HBV). Känsliga för detergenter, utorkning.
Oinhöljda (nakna): Endast proteinkapsid (Poliovirus, Adenovirus, Norovirus). Mer stabila i miljö.

Transmissionsvägar

Respiratoriska dropp/aerosoler (Influensa, SARS-CoV-2, Mässling)
Fekal-oral (Norovirus, Rotavirus, Poliovirus, HAV)
Blod/sexuellt (HIV, HBV, HCV)
Vektorburet (Dengue, Zika, Gul feber – myggor)
Direkt kontakt (HSV, HPV, Molluscum)

Varför klassificering är viktig

Guidar antivirala mål (polymeraser, proteaser, inträde), vaccinutveckling (höljeproteiner) och infektionskontroll (inhöljda = lättare att desinficera).

Virusinfektioner