Storleken på Streptococcus pyogenes, bakterien som orsakar halsfluss, kan variera. I genomsnitt är S. pyogenes-bakterier cirka 1-2 mikrometer (µm) i diameter. Det betyder att de är för små för att kunna ses med blotta ögat. De visas vanligtvis som sfäriska eller koccerformade celler under ett mikroskop. I kedjor eller par kan S. pyogenes-bakterier bilda kolonier upp till flera millimeter stora, vilket skapar de synliga tecknen på halsfluss, som vit eller gul var på baksidan av halsen.
