Escherichia coli (E. coli) kan klassificeras som en fakultativ anaerob. Detta innebär att även om E. coli kan överleva i närvaro av syre (aeroba förhållanden), kan den också överleva i frånvaro av syre (anaeroba förhållanden). Under aeroba förhållanden utför E. coli cellandning, en process som använder syre för att bryta ner organiska föreningar och generera energi. När syre inte är närvarande kan E. coli gå över till jäsning, en process som bryter ner organiska föreningar utan att använda syre och genererar energi i form av ATP. Som en fakultativ anaerob kan E. coli anpassa sig till olika miljöer och utnyttja den mest effektiva energiproducerande vägen som finns.
