Karyotypering: Kliniska och forskningsapplikationer
En karyotyp är en ordnad visuell profil av en organisms kromosomer — antal, storlek, bandmönster och centromerposition. Den framställs från metafas-arresterade celler (blodlympfocyter, amniocyter, benmärg).
Primära kliniska användningsområden
- Konstitutionell cytogenetik:
- Diagnostisera aneuploidi: Downs syndrom (47,XX,+21), Turners syndrom (45,X), Klinefelters syndrom (47,XXY), trisomi 18/13.
- Strukturella varianter: translokationer (balanserade/Robertsonian), inversioner, deletioner, insertioner, ringar, isokromosomer.
- Recidiverande graviditetsförlust (föräldral balanserad omarrangemang).
- Tvetydiga genitalier / skillnader i könsutveckling (DSD) utredning.
- Onkologi (förvärvade anomalier):
- Hematologiska maligniteter: t(9;22) vid CML, t(15;17) vid APL, t(8;21) vid AML, -5/-7 vid MDS.
- Solida tumörer: karakteristiska translokationer (EWSR1-FLI1 vid Ewings sarkom, SS18-SSX vid synovialsarkom).
- Övervaka klonal evolution, behandlingssvar och minimal residual sjukdom.
- Könsbestämning: XX vs. XY (och varianter: XXY, XO, XX/XY-mosaik).
- Reproduktiv genetik: Preimplantationsgenetisk testning (PGT-SR) för translokationsbärare.
Forskningsapplikationer
- Jämförande genomik: kromosommålning (Zoo-FISH) avslöjar evolutionära omarrangemang.
- Fylogenetik: karyotypkonservering och divergence över taxon.
- Artbildningsstudier: kromosomala artbildningsmodeller.
- Strålningsbiologi: dikentriker och ringar som biodosimetrar.
Begränsningar och moderna kompletteringar
- Upplösning ~5–10 Mb (missar mikrodeletioner/duplikationer).
- Kromosomalt microarray (CMA): Första val vid utvecklingsstörningar (upptäcker CNV <100 kb).
- FISH: Målstyrd, snabb, interfasanalys (ingen odling krävs).
- Genomsekvensering (GS/WES): Basparupplösning; detekterar SNV, CNV och strukturella varianter.
Karyotypering förblir avgörande för balanserade omarrangemang, aneuploidibekräftelse och klassificering av hematologiska maligniteter.
