En karyotyp är en ordnad visuell visning av en individs metafaskromosomer, arrangerade efter storlek, centromerläge och bandmönster. Den är grunden i konstitutionell cytogenetik.
Standard karyotypnomenklatur (ISCN)
Exempel: 46,XX (normal kvinna) eller 47,XY,+21 (man med trisomi 21).
- Totalt kromosomantal.
- Könskromosomer.
- Avvikelser: + (vinst), – (förlust), t (translokation), inv (inversion), del (deletion), dup (duplikation), ish (ISH), arr (array).
Viktiga observationer & klinisk betydelse
1. Kromosomantal (Aneuploidi / Polyploidi)
- Trisomier: 21 (Down), 18 (Edwards), 13 (Patau), X (Klinefelter 47,XXY), XXX, XYY.
- Monosomi X: 45,X (Turner).
- Triploidi (69,XXX/XXY), Tetraploidi (92,XXXX) – oftast missfall.
2. Strukturella avvikelser
| Typ | Beskrivning | Konsekvens |
|---|
| Deletion (del) | Förlust av segment | Kontinuitetsgensyndrom (t.ex. 22q11.2 del = DiGeorge; 5p del = Cri-du-chat) |
| Duplikation (dup) | Extra kopia av segment | Doskänsliga gener → neuroutvecklingsstörningar (t.ex. 17p12 dup = CMT1A) |
| Translokation (t) | Utbyte mellan icke-homologa kromosomer | Balanserad: bärare oftast frisk men ↑risk obalanserade gameter. Obalanserad: partiell trisomi/monosomi. |
| Inversion (inv) | Segment vänd änd-för-änd | Paracentrisk (ingen centromer) / peracentrisk (inkl centromer). Risk för rekombinanta gameter. |
| Ringkromosom (r) | Två brott + fusion av ändar | Instabilitet, variabel fenotyp (t.ex. r14, r20). |
| Isokromosom (i) | Spegelbild arms (centromerfelindelning) | i(Xq) i Turner; i(17q) i cancer. |
3. Bandmönster (G-banding standard)
- Trypsin-Giemsa → AT-rika (mörka) / GC-rika (ljusa) band (~400–550 band/haploid).
- Högupplösning (prometafas) → 800+ band; upptäcker mindre omarrangemang (<5 Mb).
- Övriga: Q (kinakrin), R (omvänd), C (centromerisk), NOR (nukleolär organisator).
4. Könskromosomkonstitution
- 46,XX (kvinna), 46,XY (man).
- Variationer: 45,X; 47,XXY; 47,XYY; 47,XXX; 48,XXXY; etc.
5. Mosaicism
- Två eller fler cellinjer från en zigot (post-zygotisk mutation).
- Notation: 46,XX/47,XX,+21. Nivå (%) varierar med vävnad.
- Klinisk variabilitet: mildare, atypiska fenotyper.
6. Markörkromosomer
- Lilla, strukturell avvikande, oidentifierbara med bandning.
- Kräver FISH/mikroarray/sekvensering för ursprung (centromer, eukromatin).
- Associerade med syndrom (t.ex. cat-eye syndrom: inv dup 22).
Kliniska indikationer
- Prenatal: avancerad mödralålder, positiv screening, US-avvikelser, hereditet.
- Pediatrisk: dysmorfi, DD/ID, multipel medfödda anomalier, tvetydiga genitalier.
- Reproduktiv: återkommande missfall, infertilitet, manlig faktor (azoospermi).
- Onkologi: hematologiska maligniteter (t(9;22), t(15;17), etc.) – separat från konstitutionell.
Begränsningar & Kompletterande tester
- Upplösning: ~5–10 Mb (missar mikrodeletioner/duplikationer).
- Balanserade omarrangemang kan missas om kryptiska.
- Kromosomalt Mikroarray (CMA) nu förstahandsval för DD/ID/medfödda anomalier (upptäcker CNV <100 kb).
- Exom/Genomsekvensering för engengenerstörningar.
- Karyotyp förblir avgörande för balanserade omarrangemang, aneuploidi, mosaicismnivå, ringkromosomer, och prenatal diagnostik.
