Paraffinolja är brandfarlig och har en låg flampunkt (vanligen runt 200°C), så den anses generellt inte vara säker att autoklavera. Paraffinoljeånga kan också skapa en explosiv atmosfär om den kommer i kontakt med en värmekälla. Dessutom kan paraffinolja reagera med syre för att bilda peroxider, som kan vara stötkänsliga och potentiellt explosiva.
På grund av dess brandfarlighet och andra farliga egenskaper rekommenderas inte autoklavering av paraffinolja och bör undvikas. Alternativa metoder för att sterilisera eller desinficera material eller utrustning bör istället användas.
