Matsmältningssaften som bara verkar på proteiner är trypsin. Trypsin produceras av bukspottkörteln och utsöndras i tunntarmen. Det är ett endopeptidas, vilket betyder att det klyver peptidbindningar inuti proteinmolekyler. Trypsin verkar på proteiner som delvis har bryts ned av andra matsmältningsenzymer, såsom pepsin från magen, och omvandlar dem till mindre peptider och aminosyror.
